SURFSeq 5000为用户提供Balanced Mode(BM,均衡模式)和Enhanced Mode(EM,增强模式)两大Q40测序模式。
• 在Balanced Mode下,SURFSeq 5000可实现≥90% bases≥Q30,≥85% bases≥Q40。
• 在Enhanced Mode下,SURFSeq 5000可实现≥95% bases≥Q30,≥90% bases≥Q40。
*Q30/Q40%基于j9游会真人游戏第一品牌⽣物企业标准品文库多轮测试结果的中位数值设定,该数值受到样本状态、⽂库质量和定量准确性等因素的影响而发生变化。
• Balanced Mode是平衡数据质量和芯片利用率的最优解。在该模式下,我们统计了近3个⽉,SURFSeq 5000FCH芯片7大类应用方向共116轮的测试数据。其中100轮Balanced Mode PE150测序数据的Q30、Q40均值达分别达到了95.1%和91.3%,Output reads均值达到了2500M reads(官标2000M reads)。
• 全新的Enhanced Mode在Balanced Mode的基础上,加入了基于机器学习构建的序列特征模型等多维信息,全新的“3D Basecall”可更全面的识别测序过程中的“问题序列区域”,并更准确地进行碱基识别和Q值打分。统计16轮Enhanced Mode下WGS PE150测序数据,Q30、Q40均值达分别达到了97.1%和95.2%,Output reads均值达到了2350M reads。
*在数据产量Output reads方面,Enhanced Mode相比Balanced Mode会有5%±2%水平的降低(该差异水平依据为“对相同原始图像分别使用两种模式下basecall算法获得的数据差值”),降低比例受到样本状态、文库构建方式及质量和文库定量精准度等因素影响。